予告編
一年前、リーフを助け出し、その半年後、父をジョウト地方で見つけ、伝説のポケモン、アルセウスが生み出した伝説のポケモン、ディアルガ、パルキア、ギラティナを使い、リーフ達を10年前の過去、シンオウ地方へと連れていかれた。
「貴方は、どうしたいの?」
「いやだよ…離れたくない」
「…私は私の事をするだけよ、アラン」
「俺は、皆を守りたい…」
知らされていなかった真実が、二人から明かされる時、三人の答えを聞く。
「俺は…俺は付いていくよ、リーフとグリーンと一緒に!!」
「いつだって、一緒さ」
「私は……私はっ!!」
時を使い、時を司る者。過去から現代へ。そして、アランからリーフへヤツを止めたいか、本当の事を、本当の答えを聞く。
「私は……」
「答えはすぐじゃなくてもいい。だけど、あまり時間は残されてないよ?」
共に戦って来た仲間たちと今、決戦の時が幕を開ける。
そして、新たな地方へ歩む者も居た―